ยานอวกาศกาลิเลโอซึ่งเป็นยานลำแรกที่โคจรรอบดาวพฤหัสบดี ได้ค้นพบครั้งสำคัญว่าแกนีมีดมีแมกนีโตสเฟียร์ของตัวเอง ซึ่งเป็นบริเวณที่มีอนุภาคมีประจุไฟฟ้าล้อมรอบดาวเคราะห์หลายดวง แต่ไม่เคยมีการค้นพบรอบดวงจันทร์มาก่อน กาลิเลโอยังจับเสียงหวีดหวิว แกนีมีด และไฟฟ้าสถิตที่เกิดจากแมกนีโตสเฟียร์ของแกนีมีดได้  แกนีมีด ดวงจันทร์ดวงใหญ่ที่สุดในระบบสุริยะโคจรรอบดาวพฤหัสบดีมีมหาสมุทรใต้ดินซึ่งมีน้ำมากกว่ามหาสมุทรทั้งหมดบนโลก นักวิทยาศาสตร์ค่อนข้างมั่นใจในการมีอยู่ของมหาสมุทร โดยพิจารณาจากพื้นผิวน้ำแข็งที่ราบเรียบของดวงจันทร์ ซึ่งเป็นหลักฐานของการโผล่ขึ้นมาใหม่อีกครั้งของมหาสมุทร และข้อสังเกตอื่นๆ แต่ข้อสังเกตใหม่โดยกล้องโทรทรรศน์อวกาศฮับเบิลซึ่งเผยแพร่ทางออนไลน์ในวารสารJournal of Geophysical Research Space Physicsได้ขจัดข้อสงสัยที่เหลืออยู่ออกไป ตอนนี้แกนีมีดเข้าร่วมกับยูโรปาของดาวพฤหัสบดีและดวงจันทร์สองดวงของดาวเสาร์ ไททันและเอนเซลาดัส เป็นดวงจันทร์ที่มีมหาสมุทรใต้ผิวดินและเป็นจุดที่ดีในการค้นหาสิ่งมีชีวิต เซเรส วัตถุที่ใหญ่ที่สุดในแถบดาวเคราะห์น้อยอาจมีมหาสมุทรใต้ผิวดินด้วย ผลลัพธ์ใหม่มาจากการสังเกตการณ์ของฮับเบิลเกี่ยวกับสนามแม่เหล็กของแกนีมีด ซึ่งสร้างแถบแสงออโรราสองเส้นที่สามารถตรวจจับได้ในรังสีอัลตราไวโอเลต เนื่องจากการมีปฏิสัมพันธ์กับสนามแม่เหล็กของดาวพฤหัสบดีเอง แถบเหล่านี้จึงโยกไปมาได้ อย่างไรก็ตาม มีสนามแม่เหล็กที่สามในการผสม สนามหนึ่งออกมาจากมหาสมุทรน้ำเค็มที่นำไฟฟ้าได้ และถูกเหนี่ยวนำโดยสนามของดาวพฤหัสบดี ซึ่งจะถ่วงดุลสนามของดาวพฤหัสบดีและลดการโยกของแถบแสงออโรร่า การศึกษาของฮับเบิลชี้ให้เห็นว่ามหาสมุทรสามารถอยู่ลึกลงไปใต้พื้นผิวได้ไม่เกิน 330 กิโลเมตร